Sulla USS Allegiance, viene trovato impiccato un sottufficiale in attesa di andare in congedo temporaneo. Si sospetta un suicidio, visto che a bordo ne erano avvenuti altri due recentemente.
L'N.C.I.S. riceve un messaggio contenente una serie di numeri ed i documenti di due uomini uccisi con lo stesso modus operandi nella stessa mattina. Uno dei due casi è affidato all'F.B.I. e l'altro all'N.C.I.S.